DSLRBOT というiPhoneアプリ。
IRトランスミッタ経由で赤外線コントロールでき、
下記によると、ムービーの開始停止もできるように読める。 
http://www.dslrbot.com/features/movie-mode/#more-442

これはちょっといいかも。 無論、Canonに限りません。Nikkonでもリモートコントロール可能なようです。